Збирають насіння лілій у тому випадку, якщо хочуть отримати новий сорт. Цей спосіб розмноження досить трудомісткий і тривалий. У ранньоцвітних гібридів уже до осені на місці квітів дозрівають насіннєві коробочки. Їх зрізають, викладають на папір і чекають, коли коробочки повністю розкриються.
Якщо насіння не встигло дозріти до похолодання, зелені коробочки разом зі стеблами зрізають і ставлять у воду в теплій кімнаті. У воду додають добриво. На світлі протягом місяця насіння дозріває, головне – змінювати воду та стежити, щоб стебла не загнили.
Пізні гібриди до осені переносять у горщик разом із цибулиною. У теплому приміщенні та на світлі насіння продовжують розвиватися. Їх знімають, коли коробочки жовтіють і зморщуються.